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用作物秸秆、树叶、杂草、锯末、酒糟、糠醛渣等有机废弃物做原料。先将原料水分控制在70%左右，如原料中水分较少，要用水浇湿浇透，保证水分适当。较长的作物秸秆如玉米秆、高梁杆需进行粉碎，(因原料太长，不便拌种和翻倒。)每1000公斤干基原料用水浇湿浇透后可用5公斤菌液＋1%的豆饼或尿素拌均，撒在原料中翻倒混匀，然后堆成宽2米、高1米长度不限的条形堆，用塑料布盖好即可。经过24小时堆内温度可达50℃左右，48小时温度可上升至70℃左右，经过几天的持续高温，堆温逐步下降，大约二周左右时间，发酵后的原料全部腐熟，原料中的虫卵、草籽及病源菌全被杀死，秸秆变成褐色或黑褐色，堆体比刚堆时塌陷1/3或1/2。发酵后的原料用手握之柔软有弹性，干时很脆，容易破碎。此时秸秆等原料发酵过程全部完成，用这种方法发酵成的有机肥，可直接用于农作物做基肥使用，也可倒碎过筛，装袋作为商品肥出售。
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一、场地的选择。制肥场地应选择地势平坦，靠近水源的背风向阳处，一年四季均可露天制作。
二、材料的准备(以1吨干秸秆为例)。
①作物秸秆1000公斤。
②饼粉20公斤。花生饼、豆饼、棉籽饼、菜籽饼等均可，无饼粉可用10公斤尿素代替。
③秸秆发酵剂1公斤。
三、制作方法。
①把作物秸秆(如玉米秆)用粉碎机粉碎或用铡草机切断，一般长度以1～3厘米为宜(麦秸、稻草、树叶、杂草、花生秧、豆秸等可直接使用发酵，但粉碎后发酵效果更佳)。咨询威信：幺吴二九零巴巴二零二巴
②把粉碎或切断后的秸秆用水浇湿、渗透，秸秆含水量一般掌握在70%左右。
③用20公斤饼粉同1公斤有机肥发酵剂菌液拌匀，用手均匀地把拌有有机肥发酵剂的饼粉撒在用水浇过的秸秆表面。用铁锹等工具翻拌一遍，堆成宽2米、高1.5米、长度不限的长条，用塑料布盖严即可。
四、腐化过程。
①升温阶段：从常温升到50℃，一般只需一天。
②高温阶段：从50～70℃一般只需2天。
③降温阶段：从高温度降到50℃以下，一般10天左右，此时秸秆制肥过程基本完成，肥料可直接施用。
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五、腐熟标志。
⑴秸秆变成褐色或黑褐色，湿时用手握之柔软有弹性，干时很脆容易破碎。
⑵腐熟后堆体比刚堆时塌陷1/3或1/2。
六、施用方法。
⑴秸秆肥一般用作基肥，可潮湿施用。做追肥应覆土。半腐熟的肥料施用于生长期较长的作物，腐熟度高的秸秆肥施用于生长期较短的瓜果蔬菜等作物，沙性地用半腐熟的肥料，黏土地最好施用腐熟度高的肥料。
⑵秸秆肥中有机质十分丰富，氮、磷、钾养分较为均衡，还含有各种微量元素，是各种作物、各种土壤都适宜的常用肥料，具有提高产品品质、增加产量的显著效果。
目前的社会正在逼迫养殖业在默默的进行改革，慢慢的走向绿色生态的养殖方向，这就是不断新技术发展起来的良好环境。使用有机肥发酵剂发酵秸秆做生物有机肥，已经是在全球推广的技术，最早起源于日本，现在日本的农牧业已经完全普及EM菌微生物的使用，在近十年的中国大型养殖厂通过考察学习，也已经对于这方面了如指掌。